食品经营许可证的申请流程如下：

1、填写好食品经营许可证的申请表。

2、准备法人身份证复印件、从业人员身份证复印件和健康证。然后制定食品安全管理制度。

3、绘制店铺的平面图。提交缴纳税费单据证明，证实自己所使用的水是正规自来水公司提供的。

4、到当地市场监督管理局申请材料。

5、资料提交成功之后，相关部门会安排人员来看场地。

6、检查通过后，在一定时间内通知申请人来领取食品经营许可证。