如果企业没有按时、按规进行申报纳税，税务部门可能会对企业进行罚款，并且导致企业的信用记录受损。公司长期零申报存在一定的风险，至长不能超过六个月。

一般情况下，企业如果连续三个月进行零申报的话，就会被列入税务重点监管对象，而长期零申报超过六个月的企业，会被列入非正常户。

公司成立后无正当理由超过6个月未开业的，或者开业后自行停业连续6个月以上的，公司登记机关会依法吊销公司的营业执照。