企业进行线下人工窗口补申报，需要准备好包括补申报申请书、逾期申报说明、税务机关要求的其他材料等。并所有资料提交给当地税务机关，并缴纳相应的滞纳金和罚款。税务机关审核通过后，企业可以重新计算自己的纳税义务，并进行缴纳。

企业在补申报时，应该尽快完成申报和缴费。如果逾期时间较长或情节较严重，可能会导致更高的罚款和其他法律责任。