准备材料：包括申请表、许可证原件、法人或负责人身份证明等。

提交申请：将准备好的申请材料提交给当地的监管部门。部分地区可能要求线上提交申请。

核查和审批：相关部门会对提交的申请材料进行核查和审批，确保申请符合相关法规和规定。

审批结果通知：申请人会收到相关部门的审批结果通知，确认是否批准注销。

返还证件：如果注销申请获得批准，申请人需要将原有的医疗器械经营许可证原件返还给相关部门。