中小公司在与代理记账公司进行交接时，需准备以下材料：

（1）营业执照、税务登记证等证照原件及复印件；

（2）财务账簿、会计凭证、财务报表等财务资料；

（3）银行开户许可证、网银U盾等银行相关资料；

（4）公司合同、发票等相关资料。