公司出口退税的办理流程：

一、登录退税系统，将提前出口明细资料录入，等待审核。

二、增值税发票要在发票认证系统上进行审核认证。

三、准备好进货的明细资料，将文件都录入进系统。

四、在线上提前进行预申报。

五、准备退税所需资料，其中包括：报关单、装箱单、出口核销单、增值税发票等，接下来制作退税申报软盘。

六、提交退税材料，领取退税汇总表。

七、在申请系统中获得出口退税的申请表，完成填写后提交到税务局。