分公司的账务是可以自己处理的，只要分公司有条件可以独立会计核算，并非一定要汇总。一般分公司在增值税上都是就地预缴，若符合规定的，分公司会有自己的账务处理方式，也会安排专门的会计人员来处理好，也就不需要汇总并入到总公司了，与总公司在财务上就可当作是两家公司。